अकादमी की प्रकाशन क्रियाकलापों की जड़ें 1935में रखी गई जो कि अकादमी की नींव की गहराइयों तक जा चुकी है क्योंकि यह क्रियाकलाप अकादमी के मूल क्रियाकलापों में से एक रहा है। इन गतिविधियों में तीन अग्रणी जर्नलों का प्रकाशन सम्मिलित है जिनके नाम हैं प्रोसीडिंग्स ऑफ द इंडियन नेशनल साइंस एकेडमी, इंडियन जर्नल ऑफ प्योर एंड अप्लाइड मैथेमेटिक्स (आई.जे.पी.ए.एम) और इंडियन जर्नल ऑफ हिस्ट्री ऑफ साइंस (आई.जे.एच.एस)। इसके अतिरिक्त अकादमी अपनी ईयर बुक, वार्षिक रिपोर्ट , इन्सा समाचार , अध्येताओं के सार-संग्रह और दिवंगत अध्येताओं के जीवन संबंधी संस्मरणों का प्रकाशन समय-समय पर और विशेष प्रकाशन सामग्री एवं इन्सा सेमीनार/संगोष्ठी की कार्यवाहियों का नियमित प्रकाशन करवाती है। अकादमी ने प्रकाशन क्रियाकलापों को और अधिक समर्थ बनाने के लिए बहुमूल्य मार्गदर्शन देने के लिए एक प्रकाशन सलाहकार बोर्ड (पीएबी) का गठन किया है।